domingo, 1 de dezembro de 2013

Ferramentas analíticas e bancos de dados para metagenômica na era do sequenciamento de próxima geração


Resumo
A metagenômica se tornou uma das ferramentas de bioinformática indispensáveis na biologia microbiológica nas ultimas duas décadas, e uma nova revolução nos estudos de metagenômica está prestes a começar, com a ajuda dos recentes avanços nas técnicas de sequenciamento. A produção massiva de dados e a redução substancial de custos no sequenciamento de nova geração levou a um rápido crescimento em pesquisas de metagenômica tanto quantitativamente quanto qualitativamente. É evidente que a metagenômica será uma ferramenta essencial no estudo da diversidade e da função dos microbiomas no futuro, como os métodos de impressão digital tem feito até hoje. Ao passo que a velocidade de acúmulo de dados aumenta, ferramentas de bioinformática e bancos de dados associados para lidar com toda essa quantidade de dados são necessários. Para facilitar a análise bioinformática de dados metagenômicos, nós revisamos algumas ferramentas recentes e bancos de dados que são vastamente usados nesse campo e damos alguns "insights" sobre os desafios atuais e sobre o futuro da metagenômica visto da perspectiva da bioinformática.

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