Bioinformática

Na última década, desvendar genomas completos se tornou algo 10 mil vezes mais barato, mas hoje a grande questão é como analisar os bilhões de bits gerados por computadores – faltam softwares e mão de obra especializada para tanto trabalho. Diante dessa realidade, têm surgido novas linhas de pesquisa em bioinformática a fim de encontrar uma forma mais eficaz e simples de análise.

A bioinformática, como o próprio nome já diz, é uma área de pesquisa posicionados na interface entre duas ciências, informática e biologia. O desenvolvimento da bioinformática deve ser entendido como uma grande  "revolução genômica" e rápido desenvolvimento de tecnologia da informação. A bioinformática é uma resposta às necessidades urgente onde  tem  ferramentas que possibilitem gerenciar, interpretar e distribuir grande volume de informações obtidas a partir de projetos genoma. Assim, a bioinformática é responsável pelo desenvolvimento de fórmulas e modelos matemáticos onde os pesquisadores irão realizar a comparação de seqüências, encontrando ORF, estudo conformacional, biomoléculas e resolução de filogenias. A bioinformática é utilizada para taxonomia e filogenia.

A internet tornando-se uma ferramenta básica de gestão e distribuição de todas as informações relativas à genômica e projetos proteomicos. Para realizar os objetivos, a bioinformática tem uma série de bases de dados e outros pacotes software. De todos os bancos de dados disponíveis destaca-se o GenBank.

As sequências de nucleotídeos serão comparadas com sequências do GenBank (acessadas através do NCBI- National Center for Biotechnology Information) usando o programa BLAST que serve para identificar a qual espécie pertence o DNA sequenciado. O NCBI foi criado para desenvolver ferramentas de bioinformática para armazenar e analisar todo o conhecimento sobre a biologia molecular, bioquímica e genética.

Além do NCBI, atualmente é possivel contar com diversos bancos de dados DDBJ(DNA Data Bank of Japan), EMBL-EBI EMBL-EBI(European Bioinformatics Institute), INSDC (união do DDBJ, NCBI e EMBL-EBI), PDB,  além de bancos especificos, como o SWISSPROT e SWISS Moldel de proteínas, e o KEGG e ENZYME que são especificos de ezimas.  Em todos é possivel se localizar dados sobre certos genes, proteinas, estruturas, funções, entre outros.

Contudo, não há apenas bancos de dados de busca disponiveis atualmente na internet, é possivel encontrar programas/softwares de analise online, como o Primer 3 Plus que produz primers, o CAP 3 que serve para montar genomas,  Tandem Repeats Finder que encontra repetições em tandem em sequências, WebCutter e Restriction Mapper que encontram enzimas de restrições a partir de uma sequência inserida, OligoAnalyzer que fornece a avalia primers,  CLUSTALW que como o BLAST é capaz de achar similaridade entre sequências, entre outros varios programas onlines que se é possivel usar/encontrar.