Análise metagenômica revela possíveis maneiras de biodegradação de pesticidas persistentes em água doce e sedimentos marinhos

Resumo 

A abundância e diversidade de genes de biodegradação (BDGs) e vias de degradação potenciais de diclorodifeniltricloroetano (DDT) , hexaclorociclohexano (HCH) e atrazina (ATZ) em água doce e sedimentos marinhos foram investigados por meio de análise metagenômica com 6 conjuntos de dados (16 GB no total). Os conjuntos de dados foram obtidos usando seqüenciamento Illumina. Os resultados mostraram que a abundância e a diversidade de BDGs , DDGS variou de acordo com fonte da amostra e locais escolhidos para amostragem. Os genes que codificam para a peroxidase e outros genes importantes. Identificou-se 69 gêneros capazes de degradar os poluentes orgânicos, estes eram em sua maioria filiados com Proteobacteria (49,3%) e Actinobacteria (21,7%) . Quatro gêneros, incluindo Plesiocystis, Anaerolinea, Jannaschia e Mycobacterium foram as principais populações de biodegradação em todos os sedimentos. Neste estudo, as vias de biodegradação quase completos de DDT e ATZ foram encontrados e a via de degradação parcial de HCH foi detectado em todos os sedimentos.

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